首先，要挑纹路密的，这样的苦瓜苦味浓，苦瓜素越多；而纹路宽的苦味就淡。其次，苦瓜身上一粒粒的小疙瘩也是判断瓜好坏的特征。一般来说，疙瘩颗粒愈大、愈饱满，表示瓜肉愈厚，反之则瓜肉较薄。苦瓜以翠绿色为佳，如果开始发黄则代表已经过熟，果肉不脆了。

以纸类或保鲜膜包裹储存，除可减少瓜果表面水份散失，还可保护柔嫩的瓜果，避免擦伤，损及瓜品质。