三叶芹一般株高30—6Ocm，野生种株型张开，栽培种直立。根茎很短，生出较粗的棍。叶为根出叶、具有长柄，淡绿色。叶柄先端有3片心脏形小叶，故名三叶芹。6-7月抽生花梗、开花结实。种子黑褐色，长纺锤形、有纵沟，千粒重2.25g。三叶芹性喜冷凉，忌高温干燥和强光。最适发芽温度为20℃。三叶芹种子发芽为需光性种子。